毕业生档案通常不会永久留在学校。根据我国相关政策，毕业生档案会按照规定进行转移。毕业后，档案会由学校转至学生所在地的就业指导中心或者户籍所在地的公共就业人才服务机构。这样做的目的是为了方便毕业生在就业、升学等方面进行档案的查询和使用。
当然，具体情况还需根据学校的具体规定和学生的个人情况来确定。为了确保档案的顺利转移，毕业生在离校前应仔细阅读学校的相关通知，并按照要求办理相关手续。
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