三方协议本身不会直接影响档案，但其存在可能会在后续的档案管理中产生间接影响。三方协议是应届毕业生与用人单位、学校三方签订的就业协议，主要目的是明确毕业生就业意向。以下是具体分析：
1. 档案存放：在签订三方协议后，学生的档案一般会从学校转到就业单位。如果学生毕业后未能按时到用人单位报到，档案可能会继续保留在学校，这可能会影响档案的存放和管理。
2. 档案转递：三方协议在档案转递过程中起到了一定的参考作用。用人单位可以根据协议内容，了解毕业生的就业意向和基本情况。但档案转递的具体流程和规定仍需遵循国家和地方的相关政策。
3. 档案调取：如果学生在就业过程中因各种原因需要调取档案，三方协议可以作为参考材料。但档案调取的主要依据是学生的个人意愿和实际需求。
4. 违约责任：三方协议中可能包含违约责任条款，若毕业生违约，可能会影响个人信用记录，进而影响档案管理。
总之，三方协议对档案的影响主要体现在档案存放、转递、调取等方面。但只要遵循相关政策和规定，档案管理一般不会受到太大影响。
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