新兵入伍团员证明的申请流程如下：
1. 准备材料：首先，需要准备以下材料：
- 个人的身份证原件及复印件；
- 入伍通知书；
- 学校团组织关系证明；
- 近期一寸免冠彩色照片。
2. 咨询学校团委：联系所在学校的团委，了解具体办理流程和所需材料。
3. 填写申请表：根据学校团委的要求，填写团员证明申请表。
4. 提交材料：将准备好的材料提交给学校团委。
5. 审核材料：学校团委对提交的材料进行审核。
6. 颁发证明：审核通过后，学校团委将颁发团员证明。
7. 办理转入手续：持团员证明到入伍所在部队的团组织办理团员组织关系转入手续。
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