公费医学生专科和本科的待遇在多数情况下是不一样的。通常情况下，本科层次的公费医学生享受的待遇会更高，这主要是因为本科教育周期更长，学生接受的专业知识和技能培训更为全面。具体待遇差异可能包括：
1. 经济补贴：本科层次的公费医学生通常可以获得更高的经济补贴。
2. 奖学金：本科医学生可能更容易获得奖学金，且金额可能更高。
3. 就业前景：本科毕业生在就业市场上通常具有更好的竞争力，尤其是在公立医院等机构就业时，学历优势更为明显。
4. 职业发展：本科及以上学历的医学生在职业晋升方面通常有更多机会。
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