上海复旦大学医学系校区是在复旦大学本部里面吗

是的，上海复旦大学医学系校区位于复旦大学本部内部。复旦大学医学部作为复旦大学的一个重要组成部分，与主校区紧密相连，共同构成了复旦大学庞大的校园体系。

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