考研盗版课程被查的原因主要在于以下几点：
1. 版权侵犯：盗版课程侵犯了正版课程版权方的合法权益，破坏了市场秩序。
2. 质量难以保证：盗版课程往往没有经过严格的质量控制，内容可能不准确或存在错误，影响考生备考质量。
3. 信息安全风险：使用盗版课程可能存在安全隐患，如个人信息泄露等。
4. 教育公平问题：盗版课程的存在可能使得一些经济条件较差的考生无法获得正版优质资源，影响教育公平。
5. 法律法规约束：我国《著作权法》等相关法律法规对版权保护有明确规定，盗版行为将受到法律制裁。
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